MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008500	ACT	2	6	64	69	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326680
2	NC_008500	CAA	2	6	98	103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326680
3	NC_008500	TTC	2	6	119	124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326680
4	NC_008500	T	6	6	304	309	0 %	100 %	0 %	0 %	116326680
5	NC_008500	GAA	2	6	336	341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326680
6	NC_008500	AAT	2	6	363	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326680
7	NC_008500	T	7	7	1063	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	116326681
8	NC_008500	ACA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326681
9	NC_008500	CTGTT	2	10	1129	1138	0 %	60 %	20 %	20 %	116326681
10	NC_008500	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326681
11	NC_008500	TAG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326681
12	NC_008500	GTA	2	6	1286	1291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326681
13	NC_008500	T	6	6	1381	1386	0 %	100 %	0 %	0 %	116326681
14	NC_008500	TCA	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326681
15	NC_008500	T	6	6	1479	1484	0 %	100 %	0 %	0 %	116326681
16	NC_008500	ACA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326681
17	NC_008500	TCA	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326681
18	NC_008500	CTT	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326682
19	NC_008500	CATTG	2	10	2438	2447	20 %	40 %	20 %	20 %	116326682
20	NC_008500	T	6	6	2465	2470	0 %	100 %	0 %	0 %	116326682
21	NC_008500	AAT	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326682
22	NC_008500	TAA	2	6	2497	2502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326682
23	NC_008500	TGA	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326682
24	NC_008500	TTC	2	6	2537	2542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326682
25	NC_008500	CCA	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326682
26	NC_008500	ATTCTT	2	12	2684	2695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116326682
27	NC_008500	TTGC	2	8	2707	2714	0 %	50 %	25 %	25 %	116326682
28	NC_008500	TCG	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326682
29	NC_008500	CAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326682
30	NC_008500	TC	3	6	2745	2750	0 %	50 %	0 %	50 %	116326682
31	NC_008500	TCT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326682
32	NC_008500	CTT	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326682
33	NC_008500	AT	3	6	2970	2975	50 %	50 %	0 %	0 %	116326682
34	NC_008500	GCTT	2	8	3009	3016	0 %	50 %	25 %	25 %	116326682
35	NC_008500	AAC	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326682
36	NC_008500	GAC	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326682
37	NC_008500	ATC	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326682
38	NC_008500	T	7	7	3146	3152	0 %	100 %	0 %	0 %	116326682
39	NC_008500	ATT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326682
40	NC_008500	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	116326682
41	NC_008500	TCA	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326682
42	NC_008500	TTCTT	2	10	3820	3829	0 %	80 %	0 %	20 %	116326683
43	NC_008500	CAA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326683
44	NC_008500	T	7	7	3949	3955	0 %	100 %	0 %	0 %	116326683
45	NC_008500	GTTT	2	8	3996	4003	0 %	75 %	25 %	0 %	116326683
46	NC_008500	TTC	2	6	4005	4010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326683

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.